近幾年，我國的微生物肥料產業發展迅速，從2006年的500家增加到800余家，其中：獲得正式登記證企業200家，總產量由500萬噸增加到800萬噸，產值已超百億元的產業規模，應用面積在一億畝以上，尤其在國家生態示范區、綠色和有機農產品基地中其用量超過400萬噸，約占我國微生物肥料年產量的50%，這一數字還呈不斷上升趨勢，微生物肥料已發展成為我國農業生物產業的重要組成部分。

     據統計，目前我國化肥施用純量超過5000萬噸，實物量約1.4億噸左右。如果我國生物有機肥占無機復合肥用量的10%，則年需微生物肥料達14萬噸，與現有生產能力相比，供求差額巨大。目前，歐洲許多國家微生物肥料的使用比例已經達到45-60%，美國的使用比例高達60-70%。隨著我國人民生活水平的提高，人們對農產品品質和產地環境的要求越來越高，有機食品、生態食品和綠色食品將逐漸占領高端市場。按現在的發展勢頭，預計到2012年我國微生物肥總產量達到1000萬噸以上，市場發展前景看好。